當時擔任代理黨主席的副總統吳敦義則特別裁示，
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，請相關黨務主管綜整資訊，
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，依法理情正確處置，
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，「適時適切對正確的事情予以聲援」。國民黨立委呂學樟昨受訪表示，
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，李全教當時解釋，
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，他被主任檢察官蔡麗宜提起當選無效之訴，
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，而蔡麗宜的丈夫又是此案的承審法官王參和，
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，起訴他判刑的人都是自己人，難道不用迴避？而且台南市秘書長陳美玲跟地檢署關係非常密切，李全教質疑幕後有政治力介入。值得注意的是，立法院上會期休會前，呂學樟因認為台南與屏東地檢署介入地方選舉，提案凍結兩個地檢署的預算，分別為2465萬7000元與1177萬1000元，引發民進黨立委林淑芬不滿，質疑此舉報復台南地檢署查頂新案，所以趁機修理。後來，呂學樟舉行記者會反擊，民進黨立委政治鬥爭，在網路上抹黑他，立法院司法法制委員會已決議，所有地檢署預算凍結10分之1，他便撤回凍結預算提案。針對賴清德帶頭抵制進入議會，李全教一月初北上出席中常會時曾說，他的議員選區，是台南唯一藍遠大於綠的選區，根本不需要買票，也不可能買票。他強調，台南議長選舉所以翻盤，根本是民進黨派系內鬥結果，選前他根本就不清楚綠營議員會倒戈支持。說到激動處，當時李全教語帶哽咽指控，賴清德影響司法，對他鋪天蓋地打壓與污衊，若最後司法判他判當選無效，「我會以死來明志。」他並說，若能證明他涉及賄選，將宣布退出政壇，請綠營不要血口噴人。，