上海自貿區由於向全球開放，
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，商機與想像空間極大，
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，加上開放資本帳、人民幣自由兌換，
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，大力發展離岸金融，
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，解決台商在大陸長久以來資金流動的頭號難題，
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，不少台企摩拳擦掌有意進駐；相較之下，
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，對自經區則興趣缺缺，甚至有業者私下透露，已有台商至自貿區申請註冊搶先卡位。
10月1日上海自貿區上路後，台灣自經區競爭優勢正加速流失。華東師範大學兩岸交流與區域發展研究所副所長包承柯認為，相較大陸，台灣的保險業、倉儲、金融、航運、物流、專業服務等行業發展，具備相對優勢，一旦進駐自貿區，可趁此機會深入大陸內需市場搶占先機，不少台商也瞄準這股趨勢，展現高度進駐意願。
加上近年不少台灣產業出走，利基流失嚴重，許多台資企業出於離腹地更近的理由，認為上海自貿區是更好的選擇，反觀台灣的自經區上路後，產業不買單，光靠租稅優惠和鬆綁兩岸經貿限制等政策紅利，想吸引外資投資台灣或台商鮭魚返鄉，都逐漸顯示其對廠商進駐意願的吸引力不足。
不過也有台商直言，台灣自經區有民主制度的既有優勢，尤其在智財權保護上，明顯較大陸成熟，對台商而言，若以高雄港為核心，串連兩岸及全球，擴大經營績效，有助企業發展商機。
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